Yogacharya John Thomas Lopategui è nato a Brooklyn, New York e ha vissuto in Brasile per molti anni. Nel 1978, fu benedetto dall'iniziazione al Kriya Yoga da Paramahamsa Hariharananda a New York che cambiò e reindirizzò la sua vita.
Nel 1998, sotto la guida di Gurudev, ha avuto l'opportunità di ospitare alcuni programmi con Paramahamsa Prajnanananda per introdurre il Kriya Yoga in Brasile e ha fondato il primo centro a Brasilia e successivamente il secondo a San Paolo (2000). Ha ricoperto il ruolo di Center Leader a Brasilia dal 1998 al 2001, per poi trasferirsi a Miami con la sua famiglia per essere vicino a Gurudev negli ultimi anni del Maestro.
Attualmente ricopre il ruolo di Segretario nel Consiglio di Amministrazione del centro del Kriya Yoga Institute. John Thomas Lopategui è stato autorizzato a insegnare il Kriya Yoga nel maggio 2007. Ha conseguito la Laurea Triennale in Storia, la Specialistica in Educazione e attualmente sta lavorando ad un dottorato di ricerca in Educazione con una specializzazione nello sviluppo delle risorse umane.